Την πρόκριση στην επόμενη φάση του Κυπέλλου Ερασιτεχνών κατέκτησε ο Ηρόδοτος αφού επικράτησεστην Αλικαρνασσό με 1-0 του ΟΦ Ιεράπετρας χάρη σε γκολ του Κανδυλάκη στο 75'.
Στην προημιτελική φάση ο Ηρόδοτος θα υποδεχτεί στην έδρα του τον νικητή του αγώνα Λευκίμη-Τριγλία(26/4) ΗΡΟΔΟΤΟΣ: Λουτριώτης, Προβυδάκης, Τσουμάγκας, Αχιλλέως, Κανδυλάκης, Μπαλάφας, Μωραϊτης (82' Παπαδάκης), Φραγκουλακης, Μπερνιδάκης (68' Μυλωνάς), Κοιλιάρας, Μπάμπης (46' Γαρεφαλακης). ΟΦ ΙΕΡΑΠΕΤΡΑΣ: Μανουσάκης, Πηγιάκης, Δασκαλακης, Μιγγας, Χρηστάκης, Κωνσταντίνου (63' Δερμιτζάκης), Σταχτιαρης, Κοκολάκης, Πετάσης (81' Σουμπασόπουλος), Χρυσοφάκης, Περράκης (81' Μπαριτάκης). Οι τελικοί ανά όμιλο: 1η Φάση 1ος όμιλος: Ελπίδα Σκουτάρεως-ΑΕ Διδυμοτείχου 3-1 2ος όμιλος: ΠΟ Τρίγλιας-ΠΑΟ Κουφαλίων 2-1 3ος όμιλος: ΑΕ Λευκίμμης-Καστοριά 3-0 4ος όμιλος: Ολυμπιακός Λαμίας-Αλμυρού ΓΣ (20/4) 5ος όμιλος: Φωκικός-Σκουφάς Κομποτίου 2-0 6ος όμιλος: Αστέρας Βλαχιώτη-Ασπρόπυργος 3-1 7ος όμιλος: Καλαμάτα-Πανηλειακός 3-2 8ος όμιλος: Κερατσίνι-Σούρμενα 4-0 9ος όμιλος: Ηρόδοτος-ΟΦ Ιεράπετρας 1-0 2η Φάση (26/04/2017): ΑΕ Λευκίμμης-ΠΟ Τρίγλιας 3η Φάση (3/5/2017): Ηρόδοτος – ΑΕ Λευκίμμης-ΠΟ Τρίγλιας Αστέρας Βλαχιώτη – Φωκικός Καλαμάτα – Κερατσίνι Ελπίδα Σκουτάρεως – Ολυμπιακός Λαμίας ή Αλμυρού ΓΣ 4η Φάση (10/05/2017): Ηρόδοτος ή ΑΕ Λευκίμμης-ΠΟ Τρίγλιας – Αστέρας Βλαχιώτη ή Φωκικός Καλαμάτα ή Κερατσίνι – Ελπίδα Σκουτάρεως ή Ολυμπιακός Λαμίας ή Αλμυρού
